Le carnet sanitaire précise les traitements effectués, les animaux concernés et le temps d'attente avant possibilité de commercialisation des produits (traite, abattage, ponte ou récolte de miel). 
  Il peut prendre la forme d'un registre informatique, d'un carnet, d'un cahier, de fiche dans un classeur. Mais il devra pouvoir être présenté aux agents de l'Etat en cas de contrôle. Le carnet sanitaire est une obligation réglementaire d’enregistrement des traitements vétérinaires. Il a été rendu obligatoire par l’arrêté du 5 juin 2000. Comme tous les autres documents qui font partie du registre d’élevage, le carnet sanitaire ainsi que les ordonnances pour les médicaments doivent être conservé pendant au minimum 5 ans.

Les carnets sanitaires sont disponibles à L'APLMA.